După parcurgerea studiilor de licență, Facultatea de Drept din Cluj oferă posibilitatea specializării în cadrul unuia dintre cele 5 module de masterat.
Programul de masterat Științe Penale și Criminalistică este probabil cel mai popular și cu cel mai mare număr de studenți în fiecare an. Studenții au posibilitatea de a aprofunda cunoștiințele de specialitate prin intermediul unor discipline precum Drept penal al afacerilor, Criminalitate informatică sau Proceduri penale comparate.
Un program de masterat „clasic” este cel de Instituții de Drept Privat. Aici se studiază, printre altele, Contractele digitale, Probleme de drept succesoral sau Dreptul european și comparat al proprietății.
Existent de mai bine de două decenii la Facultatea de Drept din Cluj, anterior ca Drept comunitar și instituții comunitare, programul de masterat Drept European și Drept Național al Afacerilor și-a adaptat în timp structura și permite acum parcurgerea unor cursuri precum Dreptul european al concurenței, Dreptul afacerilor și autorizațiile administrative sau Regimul juridic al proprietății industriale.
Gândit ca un program de masterat dinamic, pentru business, programul Drept Internațional și Drept Comparat al Afacerilor (International and Comparative Business Law) este unul în limba engleză. Unii dintre profesorii care predau aici sunt profesori invitați de la universități de prestigiu din străinătate sau din România, iar printre studenții interesați se numără unii din Spania, Italia, Franța, Nigeria sau Kurdistan. Discipline precum Dreptul comerțului electronic, securității cibernetice și al inteligenței artificiale, Drept fiscal european sau Drept european al muncii în era digitală oferă o privire cu totul specială asupra domeniului.
În fine, dar nu în cele din urmă, Facultatea propune și un program intitulat Drept privat al Uniunii Europene, cu predare integrală în limba maghiară. Susținerea acestui program este posibilă cu ajutorul unor profesori de la Facultățile partenere din Ungaria, iar programa include cursuri precum Drept procesual civil european, Dreptul și politica de mediu ale Uniunii Europene sau Acțiunile exercitate în fața instanțelor unionale.
Toate programele de masterat încurajează cercetarea științifică aprofundată și pun la dispoziția studenților instrumente academice apte să susțină eforturile individuale. O parte a rezultatelor cercetării studenților masteranzi sunt publicate în revistele Studia Universitatis Babeș-Bolyai. Iurisprudentia, Caiete de Drept Penal și Cluj Tax Forum Journal.